Kejaksaan Negeri Bantul berdiri sejak bulan Juli tahun 1965. Beralamat di komplek Parasamya Kabupaten Bantul, namun pada perkembangannya Kejaksaan Negeri Bantul pindah di Dusun Depok, Bantul hingga tahun 1971, yang saat sekarang menjadi Jl. Dewi Sartika Baantul. Seiring dengan perkembangan tata kota pada akhirnya Kantor Kejaksaan Negeri Bantul Pada tahun 1974 menempati gedung baru di Dusun Jebugan atau yang lebih dikenal dengan Bantul Timur dan berada di Jalan R.A. Kartini No.45 Bantul. Namun pada hari Sabtu pagi buta jam 05.59 WIB tanggal 27 Mei 2005 Gempa berkekuatan 7.2 SR mengguncang wilayah Bantul, Yogyakarta, & Jateng bagian selatan, sehingga kantor Kejaksaan Negeri Bantul pun tak luput dari musibah tersebut, namun kegiatan kedinasan tidak mungkin berhenti dan hingga pada akhirnya harus pindah di kantor sementara di Dusun Ngeblak Wijirejo Pajangan Bantul, dan pada awal 2008 gedung kantor Kejaksaan Negeri Bantul telah selesai pembangunannya, yang diresmikan oleh Kepala Kejaksaan Tinggi Daerah Istimewa Yogyakarta. Dengan telah diresmikannya kantor Baru Kejaksaan Negeri Bantul tersebut maka kinerja seluruh pegawai Kejaksaan Negeri Bantul dituntut lebih profesional dalam bertugas melayani masyarakat dibidang penegakan hukum khususnya diwilayah hukum kabupaten Bantul.
